Чтобы справиться с высоким бременем COVID-19 в домах престарелых в США, в этих учреждениях широко распространены экспресс-тесты на антиген SARS-CoV-2. Однако данные о производительности отсутствуют, особенно у бессимптомных людей.

Оценить эффективность тестирования на антиген SARS-CoV-2 при использовании для тестирования в масштабах всего учреждения во время вспышки в доме престарелых.

Дизайн:

Проспективная оценка, включающая 3 раунда тестирования в масштабах всего учреждения, в ходе которых были собраны парные респираторные образцы для оценки эффективности теста на антиген BinaxNOW по сравнению с культурой вируса и полимеразной цепной реакцией с обратной транскрипцией в реальном времени (RT-PCR). Раннюю и позднюю инфекцию определяли по изменениям пороговых значений цикла ОТ-ПЦР и результатам предыдущих тестов.

Параметр:

Дом престарелых с продолжающейся вспышкой SARS-CoV-2.

Участники:

532 парных экземпляра собраны у 234 резидентов и персонала.

Размеры:

Процент положительного согласия (PPA) и процент отрицательного согласия (PNA) для BinaxNOW по сравнению с ОТ-ПЦР и культурой вируса.

Полученные результаты:

BinaxNOW PPA с вирусной культурой, используемой для обнаружения способного к репликации вируса, представлял собой 95%. Однако общий PPA при тестировании на антиген с помощью RT-PCR составил 69%, а PNA — 98%. Когда для каждого участника был проанализирован только первый положительный результат теста, PPA тестирования на антиген с помощью ОТ-ПЦР составил 82% среди 45 человек с симптомами и 52% среди 343 бессимптомных людей. По сравнению с ОТ-ПЦР и посевом вируса, тест BinaxNOW показал хорошие результаты при раннем заражении (86% и 95% соответственно) и плохие результаты при позднем заражении (51% и отсутствие восстановленного вируса соответственно).

Ограничение:

Точное определение симптомов было затруднительно для жителей домов престарелых; результаты испытаний могут не отражать результаты испытаний, проведенных внелабораторным персоналом.

Вывод:

Несмотря на более низкую положительную согласованность по сравнению с ОТ-ПЦР, положительная реакция на антигенный тест имела более высокую согласованность с выделением способного к репликации вируса. Эти результаты показывают, что тестирование на антигены может быть полезным инструментом для быстрого выявления заразных людей, подверженных риску передачи SARS-CoV-2 во время зарождающихся вспышек, и помочь снизить бремя COVID-19 в домах престарелых.

Основной источник финансирования:

Никто.

По состоянию на 10 января 2021 года в Соединенных Штатах 1 022 297 постояльцев и сотрудников домов престарелых дали положительный результат на SARS-CoV-2, вирус, вызывающий COVID-19, и 108 447 человек умерли (1). Постояльцы домов престарелых могут не иметь симптомов, иметь атипичные симптомы или быть не в состоянии описать свои симптомы словами, что делает диагностику с использованием только скрининга на основе симптомов неадекватным.2, 3). Серийное тестирование на SARS-CoV-2 в масштабах всего учреждения может помочь выявить случаи в условиях вспышки, что позволит быстро реализовать меры предосторожности, основанные на передаче, а также стратегии профилактики и контроля инфекции (3, 4). Хотя тестирование полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) в режиме реального времени, проводимое в лаборатории, имеет самую высокую чувствительность, его длительное время выполнения может задержать введение карантина и изоляции.5, 6). Кроме того, ОТ-ПЦР может быть плохим индикатором инфекционности, поскольку люди могут выделять измеримые количества вирусной РНК, несмотря на отсутствие инфекционного вируса.7–10). И наоборот, возможность культивирования вируса из клинических образцов является лучшим показателем контагиозности, чем ОТ-ПЦР.11). Положительная вирусная культура чаще всего выявляется в течение 10 дней после начала заболевания или при высокой вирусной нагрузке (>7,0 log₁₀ копий/мл) (12, 13).

Тесты на антиген просты в использовании и дают результаты за считанные минуты, что способствует быстрому действию, особенно во время вспышек в местах скопления людей (4, 14, 15). В 2020 году Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США выдало разрешение на экстренное использование (EUA) 11 экспресс-тестам на антигены. Министерство здравоохранения и социальных служб США отправило 3 из них, в том числе Agbott BinaxNOW COVID-19 Ag Card, в дома престарелых по всей стране (16). Согласно EUA 3 продуктов, среди людей с симптомами, протестированных через 5–7 дней после появления симптомов, процент положительного совпадения (PPA) тестов на антиген с RT-PCR составляет от 84% до 99%, а процент отрицательного совпадения (PNA) остается близким до 100% (16). Тем не менее, эффективность теста на антиген у бессимптомных людей и у людей с более длительным временем до появления симптомов, чем указано в EUA, недостаточно хорошо охарактеризована, со смешанными отчетами о производительности и опасениями по поводу ложноположительных результатов.16–19). Хотя математические модели предполагают потенциальные преимущества частого и быстрого тестирования даже с тестами с более низким PPA, существуют ограниченные данные о эффективности тестов на антигены при выявлении ранних инфекций SARS-CoV-2, когда люди наиболее вероятно заразны.20–22).

7 октября 2020 года дом престарелых на 149 коек в Джорджии выявил свой показательный случай COVID-19 у жителя с помощью теста на антиген BinaxNOW, что побудило провести дополнительное тестирование на антиген в учреждении. Несмотря на попытки реализовать меры по смягчению последствий, включая групповое тестирование, к 21 октября 43 жителей и 5 сотрудников дали положительный результат на SARS-CoV-2. Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC) работали с Департаментом общественного здравоохранения Джорджии, чтобы оценить эффективность теста на антиген BinaxNOW по сравнению с ОТ-ПЦР и культурой вируса. В этом отчете описываются тестовые характеристики платформы для тестирования антигенов BinaxNOW при использовании для людей с симптомами и без симптомов, последовательно тестируемых каждые 5 или 6 дней во время вспышки в домах престарелых.

Методы

Дизайн исследования и источники данных

В период с 22 октября по 3 ноября 2020 года во время продолжающейся вспышки SARS-CoV-2 3 раза в течение 13 дней было проведено серийное тестирование всех пациентов и персонала учреждения. Образцы были взяты у всех доступных и согласных жителей и сотрудников, присутствовавших в дни тестирования, включая людей, у которых до 21 октября был выявлен положительный результат на SARS-CoV-2. Во время первого раунда тестирования в масштабах всего учреждения обученный персонал проекта собрал парные двусторонние мазки из передних отделов носа (АН) жителей для тестирования на антиген и ОТ-ПЦР, а у персонала дома престарелых – мазок из АН для тестирования на антиген и мазок из носоглотки. из одной ноздри для ОТ-ПЦР. Из-за непереносимости пациентов взятие мазков из носоглотки было прекращено во время второго и третьего раундов тестирования, и у пациентов и персонала были взяты парные билатеральные мазки из носоглотки.Приложение 2). Все образцы были собраны в соответствии с рекомендациями CDC по сбору образцов и обращению с ними (4). Обученные сотрудники лаборатории протестировали 1 мазок АН на месте с использованием антигенных карточек BinaxNOW COVID-19 в соответствии с инструкциями производителя по применению (23). Другой был отправлен в CDC для ОТ-ПЦР и эталонного тестирования вирусной культуры.

Учреждение предоставило демографические характеристики и предыдущие результаты тестирования на антигены для жителей и персонала. В период с 7 по 21 октября в учреждении использовалось исключительно тестирование BinaxNOW, а предшествующая положительная реакция на антиген определялась как любой положительный результат теста на SARS-CoV-2 в течение этого времени. При каждом посещении сотрудники проекта заполняли стандартную анкету для оценки симптомов, подобных COVID-19 (24). Дееспособные жильцы и персонал сообщили о симптомах во время тестирования. Для жителей, которые не могли сообщить о себе, информация о симптомах была получена от медперсонала и электронных медицинских карт и подтверждена жителями, если это возможно. Участник с симптомами определялся как резидент или сотрудник, который на момент сбора данных сообщил о любых новых или ухудшающихся симптомах, сходных с симптомами COVID-19 (24) за 14 дней до этого раунда тестирования.

Образцы участников были протестированы на РНК SARS-CoV-2 с помощью ОТ-ПЦР с использованием мультиплексного анализа CDC Influenza SARS-CoV-2 (Flu SC2) (25) на приборе Applied Biosystems 7500 Fast Dx для ПЦР в реальном времени (Thermo Fisher Scientific). Нуклеиновую кислоту экстрагировали с помощью экстракционных платформ QIAGEN EZ1 или Roche MagNA Pure 96. Сообщалось о пороговых значениях цикла (Ct) для гена-мишени вирусного нуклеокапсидного белка SARS-CoV-2. Значения менее 40 указывали на то, что образец был положительным на РНК SARS-CoV-2. Предыдущий опыт показал невозможность обнаружения вируса, положительного к культуре, в образцах с Ct выше 34. Поэтому была предпринята попытка культивирования вируса на образцах, положительных по ОТ-ПЦР со значениями Ct 34 или менее, и отрицательных по результатам ОТ-ПЦР, положительных по антигену образцах. образцы. Культивирование проводили с использованием клеток Vero CCL-81, как описано ранее (26). Клетки, демонстрирующие цитопатический эффект в течение 8 дней после инокуляции культуры, тестировали на наличие SARS-CoV-2 с помощью ОТ-ПЦР, чтобы подтвердить выделение и рост вируса в культуре (Приложение 2).

Образцы были классифицированы по стадиям инфекции с использованием результатов предыдущих анализов и значений Ct. Стадии были определены как ранние (низкие или снижающиеся значения Ct), поздние (повышение или устойчиво высокие значения Ct), разрешенные (отрицательный результат теста у человека с предшествующим положительным результатом) или неинфицированные (последовательно отрицательные результаты в образцах, взятых у человека с отсутствие предварительного положительного результата). Таблица 1дает полные определения.

Источник: https://www.acpjournals.org/doi/full/10.7326/M21-0422?journalCode=aim